山东农业科学

2013, v.45;No.260(04) 8-11

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石榴等观赏植物DFR基因生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Dihydroflavonol 4-Reductase Gene from Pomegranate and Other Ornamental Plants

陶吉寒;冯立娟;苑兆和;招雪晴;尹燕雷;

摘要(Abstract):

根据GenBank中已登录的红花石榴、粉花石榴、姜荷花、芍药、水母雪莲、大丽花、瓜叶菊和兰花等植物二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件对其核苷酸序列的外显子、氨基酸序列的理化性质、疏水性/亲水性和跨膜结构等进行了预测。结果表明,这几种植物DFR基因均存在1个外显子,含量最丰富的氨基酸是Ala、Gly、Cys和Thr;除红花石榴和粉花石榴DFR属于不稳定蛋白外,其余植物均属于稳定蛋白。这几种植物DFR蛋白均为亲水性蛋白,存在明显的疏水区和亲水区以及跨膜结构等。

关键词(KeyWords): 石榴;二氢黄酮醇4-还原酶(DFR);生物信息学;理化性质;跨膜结构

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 山东省自然科学基金项目(ZR2009DM010)

作者(Author): 陶吉寒;冯立娟;苑兆和;招雪晴;尹燕雷;

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DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2013.04.042

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