山东农业科学

2020, v.52;No.347(07) 1-6

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花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析
Differential Expression Analysis of Transcriptome in Cauliflower Cultivars Resistant to and Susceptible to Black Rot at Seedling Stage

姚玉荣;霍建飞;郝永娟;贲海燕;王万立;

摘要(Abstract):

为研究花椰菜抗黑腐病的分子机制,本试验利用Illumina测序平台的RNA-Seq技术对花椰菜黑腐病感病品种Y1-2和抗病品种EC-247接种黑腐病菌5 d后的样本进行高通量转录组分析,采用RSEM软件计算基因表达量,并在此基础上筛选两组样本间的差异表达基因。结果显示,抗、感品种间差异表达基因共3 195个,其中上调表达基因1 424个,下调表达基因1 771个。通过GO和KEGG进行基因功能显著性富集分析发现,差异表达基因主要富集于苯丙烷类代谢、次级代谢产物合成、逆境响应、MAPK信号通路等途径。本研究结果可为解析花椰菜与黑腐病互作机制、挖掘黑腐病抗病基因提供参考。

关键词(KeyWords): 花椰菜;黑腐病;转录组;差异表达基因

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 蔬菜种质创新国家重点实验室开放课题(201802);; 天津市自然科学基金项目(18JCQNJC14900)

作者(Author): 姚玉荣;霍建飞;郝永娟;贲海燕;王万立;

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DOI:

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